在探讨大众ID.3新能源车的库存车底盘是否存在生锈问题时，我们需要从多个角度来分析这个问题，包括生产工艺、材料质量、存储环境以及车辆的使用状况等。

首先，我们要了解的是大众ID.3的生产过程和质量控制体系。作为一款新能源汽车，大众ID.3采用了先进的制造技术和严格的质量标准，以确保车辆的性能和安全。特别是在底盘的防腐蚀处理方面，大众应该有相应的措施，例如使用耐腐涂层或电镀等方式来提高底盘的抗锈能力。

其次，我们还需要考虑库存车的具体存储条件。如果车辆是在潮湿的环境中长时间存放的，那么确实有可能导致金属部件发生氧化而生锈。然而，大多数汽车制造商都会有专门的仓库设施，这些仓库通常具有良好的通风和干燥的条件，以减少车辆受潮的可能性。此外，定期移动车辆或者进行适当的维护保养也可以帮助防止生锈的发生。

再者，即使某些情况下库存车的底盘出现了轻微的生锈现象，这并不意味着车辆的安全性和性能会受到严重影响。现代汽车的底盘设计都考虑到一定的抗锈要求，并且在关键部位会有额外的防护措施。因此，即使有生锈情况，只要不是大面积严重锈蚀，一般不会影响行车安全。

最后，我们也需要考虑车主在使用过程中的保养习惯。即使是新车，如果在恶劣的道路条件下行驶或者缺乏定期的清洗和打蜡保养，同样可能导致车身底部出现生锈迹象。因此，无论是不是库存车，车主都应该重视日常的车辆护理工作，以延长车辆的使用寿命。

综上所述，对于大众ID.3新能源车的库存车底盘是否生锈的问题，我们不能一概而论。虽然理论上存在生锈的可能，但实际上这与多种因素有关，包括生产质量、存储环境和用户使用习惯等。消费者在购买二手车时应仔细检查车辆状况，同时也要参考专业检测报告和维修记录，以便做出明智的决策。